Глаголы движения с частицей направления へ, транспорт с で, совместное действие с と.
へ (читается «э») отмечает, куда идёте/приходите/возвращаетесь. С 行きます, 来ます, 帰ります.
きょうとへ いきます。
Еду в Киото.
へ отмечает направление/пункт назначения у глагола движения. Как частица темы は читается «ва», так и частица へ пишется へ, но читается «э».
で на транспорте говорит, как вы добираетесь: 電車で = «на поезде».
でんしゃで かいしゃへ いきます。
Езжу на работу на поезде.
で отмечает средство/способ — здесь транспорт. «Пешком» — 歩いて (без で).
と после человека значит «(вместе) с»: 友達と = «с другом».
ともだちと にほんへ きました。
Приехал в Японию с другом.
と связывает спутника с действием. «В одиночку» — 一人で.
いつ спрашивает «когда?». В отличие от часов и дат, оно никогда не берёт に.
いつ にほんへ きましたか。…さんがつにじゅうごにちに きました。
Когда вы приехали в Японию? … 25 марта.
いつ стоит там, где в ответе будет время. Ответу может понадобиться に (３月２５日に), а самому いつ — никогда.